셀트리온제약은 3일 최근 세무당국으로부터 부과된 법인세 99억원(가산세 포함)에 대해 "2010년 개정된 법을 소급 적용했다"며 "세무당국을 상대로 행정소송을 진행할 계획"이라고 밝혔다.
셀트리온제약은 세무당국으로 부과된 법인세 99억원에 대해 이달 중 징수유예 신청을 하고, 경정 및 불복청구를 할 예정이다. 이 같은 청구가 받아들여지지 않을 경우 서울행정법원에 행정소송을 제기할 계획이다.
앞서 국세청은 지난 2010년 영업권 상각을 절세수단으로 악용하는 사례를 막기 위해 이를 합병차익으로 보고 과세할 수 있도록 관련법을 개정했다.
예컨대 피합병회사의 주식가치가 100억원인데 순자산가치는 70억원인 경우 이를 회계처리할 때 차액인 30억원을 영업권으로 기재하는 것이다. 2010년 이전에는 이 같은 회계상 영업권에 세금을 부과하지 않았다.
그러나 세무당국이 법개정 전인 2007년 이후 합병한 기업에 대해서도 소급 적용해 일부 기업에 대해 법인세를 부과한 것이다.
세무당국은 2009년 셀트리온제약이 한서제약 합병 시 발생한 회계상 영업권 282억원이 합병차익에 해당한다며 법인세 99억원을 부과했다.
셀트리온제약 측은 "회계상 영업권은 매입가액과 순자산가치와의 차액으로 지적재산권 등 실제 자산과는 다른 회계상의 개념"이라면서 "법 개정 이전에 발생한 합병 차익에 대해 소급 적용해서 법인세를 부과하는 것은 부당하다"고 반발했다.
한편 국세청은 2013년 동부하이텍에 대해 2007년 합병당시 발생한 회계상 영업권이 합병차익에 해당된다며 778억원의 법인세를 부과했다. 동부하이텍은 이에 대해 세금징수 유예 및 행정소송을 제기해 1심에서 승소했으며, 현재 2심을 진행중이다.
